2006 (平成18) 年 8月23-24日 : 鳴門総合運動公園体育館
| 計 | 規定 | 自由 | ゆか | 跳馬 | 鉄棒 | |||
| 1. | 京都 | 宇治市立 北宇治中学校 | 170.162 | 85.637 | 84.525 | 28.550 | 28.275 | 27.700 |
| 2. | 茨城 | 水戸市立 赤塚中学校 | 169.474 | 85.949 | 83.525 | 27.700 | 28.250 | 27.575 |
| 3. | 東京 | 武蔵野東中学校 | 168.575 | 84.500 | 84.075 | 27.400 | 28.175 | 28.500 |
| 4. | 静岡 | 静岡市立 末広中学校 | 166.262 | 83.637 | 82.625 | 27.650 | 28.475 | 26.500 |
| 5. | 東京 | 練馬区立 中村中学校 | 166.025 | 83.325 | 82.700 | 27.625 | 28.025 | 27.050 |
| 6. | 和歌山 | 田辺市立 明洋中学校 | 165.212 | 83.762 | 81.450 | 26.450 | 27.500 | 27.500 |
| 7. | 愛知 | 名経大市邨中学校 | 162.475 | 82.100 | 80.375 | 27.550 | 27.350 | 26.350 |
| 8. | 佐賀 | 鳥栖市立 鳥栖中学校 | 162.475 | 82.100 | 80.375 | 26.600 | 27.275 | 26.500 |
| 9. | 鹿児島 | 鹿児島市立 谷山中学校 | 160.537 | 80.637 | 79.900 | 26.450 | 27.400 | 26.050 |
| 10. | 岩手 | 盛岡市立 北陵中学校 | 159.062 | 79.812 | 79.250 | 25.950 | 27.100 | 26.200 |
| 11. | 岡山 | 津山市立 加茂中学校 | 158.387 | 78.537 | 79.850 | 26.900 | 27.300 | 25.650 |
| 12. | 北海道 | 札幌市立 羊丘中学校 | 157.825 | 80.525 | 77.300 | 26.150 | 26.950 | 24.200 |
| 13. | 福井 | 鯖江市中央中学校 | 157.050 | 78.850 | 78.200 | 26.250 | 26.250 | 25.700 |
| 14. | 徳島 | 鳴門市立 鳴門市第一中学校 | 156.987 | 79.587 | 77.400 | 25.750 | 26.500 | 25.150 |
| 15. | 福島 | 福島市立 福島第四中学校 | 154.125 | 78.325 | 75.800 | 25.500 | 25.900 | 24.400 |
| 16. | 愛媛 | 松山市立 余土中学校 | 153.400 | 77.600 | 75.800 | 25.250 | 26.300 | 24.250 |
| 計 | 規定 | 自由 | ゆか | あん馬 | 跳馬 | 鉄棒 | ||||
| 1. | 檜山 和真 | 茨城 | 大洗町立 第一中 | 77.250 | 38.950 | 38.300 | 9.700 | 9.250 | 9.775 | 9.575 |
| 2. | 村上 雄人 | 東京 | 武蔵野東中 | 76.925 | 38.250 | 38.675 | 9.600 | 9.700 | 9.675 | 9.700 |
| 3. | 久永 将太 | 千葉 | 船橋市立 金杉台中 | 76.775 | 38.600 | 38.175 | 9.850 | 9.550 | 9.100 | 9.675 |
| 4. | 瀬島 龍三 | 京都 | 京都市立 七条中 | 76.762 | 38.887 | 37.875 | 9.775 | 9.100 | 9.525 | 9.475 |
| 5. | 佐藤 宏太 | 茨城 | 水戸市立 赤塚中 | 76.387 | 38.642 | 37.925 | 9.000 | 9.800 | 9.600 | 9.525 |
| 6. | 小友 翔太郎 | 茨城 | 水戸市立 赤塚中 | 76.250 | 38.500 | 37.750 | 9.500 | 9.750 | 9.500 | 9.000 |
| 7. | 福尾 誠 | 東京 | 練馬区立 中村中 | 76.200 | 38.300 | 37.900 | 9.625 | 9.350 | 9.525 | 9.400 |
| 8. | 横山 聖 | 大阪 | 四条畷市立 四条畷南中 | 75.950 | 38.000 | 37.950 | 9.650 | 9.150 | 9.500 | 9.650 |
| 綿崎 啓太 | 佐賀 | 鳥栖市立 鳥栖中 | 75.950 | 38.000 | 37.950 | 9.400 | 9.200 | 9.525 | 9.450 | |
| 10. | 小林 亮介 | 奈良 | 橿原市立 橿原中 | 75.900 | 38.225 | 37.675 | 8.900 | 9.725 | 9.300 | 9.750 |
| 11. | 長谷川 智将 | 石川 | 小松市立 御幸中 | 75.750 | 38.300 | 37.450 | 9.350 | 9.450 | 9.400 | 9.250 |
| 12. | 河合 将利 | 京都 | 宇治市立 北宇治中 | 75.650 | 38.525 | 37.125 | 9.800 | 8.550 | 9.525 | 9.250 |
| 13. | 若林 裕樹 | 岡山 | 岡山市立 灘崎中 | 75.475 | 37.500 | 37.975 | 9.525 | 9.450 | 9.450 | 9.550 |
| 14. | 水谷 友徳 | 愛知 | 名古屋市立 浄心中 | 75.375 | 38.275 | 37.100 | 9.400 | 9.200 | 9.500 | 9.000 |
| 15. | 日野 直紀 | 愛媛 | 松山市立 桑原中 | 75.337 | 38.637 | 36.700 | 9.250 | 9.050 | 9.000 | 9.400 |
| 16. | 桒名 勇希 | 北海道 | 網走市立 第三中 | 75.250 | 38.500 | 36.750 | 9.200 | 8.800 | 9.350 | 9.400 |
| 17. | 垣谷 拓斗 | 京都 | 向日市立 勝山中 | 75.237 | 38.037 | 37.200 | 9.150 | 9.450 | 9.400 | 9.200 |
| 18. | 上田 拓弥 | 岡山 | 倉敷市立 真備中 | 75.100 | 38.250 | 36.850 | 8.900 | 9.150 | 9.250 | 9.550 |
| 武田 一志 | 群馬 | 伊勢崎市立 あずま中 | 75.100 | 37.725 | 37.375 | 9.450 | 9.150 | 9.525 | 9.250 | |
| 20. | 中川 一平 | 東京 | 成蹊中 | 74.925 | 37.750 | 37.175 | 9.350 | 9.525 | 9.300 | 9.000 |